Prevalencija nepoznatih bakterija predstavlja uporan izazov u bolnicama. Tijekom nekoliko godina, znanstvenici sa švicarskog Sveučilišta u Baselu neumorno su skupljali i proučavali mikroorganizme u bolničkom okruženju, otkrivajući brojne nove bakterije, od kojih su neke od velike kliničke važnosti.
Bakterijske infekcije zahtijevaju brzu i točnu identifikaciju za učinkovito liječenje. Ipak, konvencionalne metode često ne uspijevaju, osobito kada se suoče s neklasificiranim bakterijskim vrstama ili vrstama koje je teško uzgojiti. Od 2014. godine, zajednički napor između Sveučilišta u Baselu i Sveučilišne bolnice u Baselu usmjeren je na uzorke koji sadrže zagonetne klice, u konačnici otkrivajući više od trideset novih bakterijskih vrsta povezanih s klinički značajnim infekcijama. Rezultati istraživanja objavljeni su u časopisu BMC Microbiology.
Predvodeći to istraživanje, tim dr. Daniela Goldenbergera primijenio je napredne tehnike, uključujući kompletnu genetsku analizu, kako bi otkrio misterije 61 bakterijskog patogena izdvojenog iz različitih uzoraka pacijenata. Tradicionalne laboratorijske metode bile su posrnule, što je potaknulo usvajanje nedavno dostupnog sveobuhvatnog pristupa sekvenciranja. Od njih ukupno 61, 35 otkrivenih bakterija je bilo potpuno nepoznato, dok se 26 pokazalo izazovnim zbog tek nedavnih dodavanja bazi podataka ili ograničenih taksonomskih opisa.
Nove intrige i zabrinutost
Najvažnije je da je sedam novih bakterijskih sojeva identificirano kao klinički relevantno, sposobno uzrokovati infekcije kod ljudi, što je značajna veza o kojoj se rijetko izvještava. Većina tih novootkrivenih vrsta pripada rodovima Corynebacterium i Schaalia, odnosno gram-pozitivnim bakterijama koje se obično nalaze u mikrobiomu i sluznici ljudske kože.
Jedan intrigantan slučaj uključivao je bakteriju otkrivenu u upaljenom palcu nakon ugriza psa, koju je ranije slučajno izolirala kanadska istraživačka skupina iz sličnih rana. Ta bakterija, nazvana Vandammella animalimorsus 2022. godine, izazvala je zabrinutost kao potencijalni patogen u nastajanju.
Bolji izgledi za borbu s bakterijama u budućnosti
Kako znanstvenici napreduju, imenovanje ovih novih vrsta ostaje prioritet, a dvije su već dobile svoje ime. Pseudoclavibacter triregionum, koji označava geografsku blizinu Basela Švicarskoj, Francuskoj i Njemačkoj, jedan je primjer imenovanja nove bakterije.
Projekt koji je u tijeku i koji je pokrenuo tim dr. Goldenbergera, nastavlja se odvijati, s više od dvadeset dodatnih identificiranih novih vrsta. Tehnološki napredak u bakteriologiji otvorio je dinamično razdoblje, potičući bogatstvo znanja o prethodno nepoznatim bakterijama.
Napredak švicarskih znanstvenika obećava poboljšane dijagnoze i učinkovitije strategije liječenja protiv infekcija uzrokovanih rijetkim patogenima u budućnosti.
Izvor: EurekAlert
