Otkriveni novi detalji interakcije koronavirusa s ljudskim stanicama, mogli bi dovesti i do razvoja novih lijekova

Da bi zarazio stanicu, virus SARS-CoV-2 koji uzrokuje bolest COVID-19, mora proći membranu ljudske stanice, a novi molekularni modeli pokazuju koji dijelovi novog koronavirusa su ključni za prolazak kroz tu membranu te na taj način otkrivaju i nove potencijalne ciljeve za lijekove.

Branimir Vorša | 25.02.2021. / 16:11 komentari
Slika nije dostupna (Foto: Zimo)

Ako zamislimo novi koronavirus poput teretnog broda, a ljudsku stanicu poput otoka, onda taj teretni brod treba pristanište na obali gdje će istovariti svoj teret, kojim će "zaraziti" taj otok.

tri vijesti o kojima se priča Pametni telefon, ilustracija Mali, ali značajna promjena Stavljate telefon na stol s ekranom prema gore? Evo zašto biste trebali promijeniti tu naviku Uređaj koji izvlači pitku vodu iz zraka Nije znanstvena fantastika Stvorili pitku vodu iz "ničega": Ovaj genijalan izum mogao bi spasiti mnoge živote Litijske baterije u automobilima, ilustracija Stručnjaci itekako skeptični, no... Huawei kaže da njihova nova baterija daje domet od 3000 kilometara i da se puni za manje od pet minuta

Prvi korak kod infekcije bio onda usidriti se na pristaništu, a drugi korak vezati se za to pristanište kako bi brod mogao na siguran način istovariti svoj teret na obalu.

Većina lijekova i cjepiva usredotočena je na blokiranje usidrenja koronavirus teretnog broda, no i netom navedeni drugi korak isto tako predstavlja potencijalnu metu za lijekove i cjepiva.

Novo istraživanje sa Sveučilišta Illinois, pozabavili su se detaljima upravo tog drugog koraka, odnosno vezanja virusa za membranu ljudske stanice, a ti detalji mogli bi omogućiti novi dizajn lijekova koji bi to blokirali.

Prije izbijanja pandemije novog koronavirusa, voditeljica istraživanja Defne Gorgun proučavala je interakcije molekula koje se lijepe za i ubacuju u membrane stanica, a kad se COVID-19 počela širiti, Gorgun je brzo preusmjerila istraživanje na razumijevanje procesa u kojem se SARS-COV-2 stapa sa stanicama.

Malo područje šiljastog proteina novog koronavirusa koje se zove "fuzijski peptid", umeće se u membranu ljudske stanice te započinje proces stapanja virusa sa stanicom. Znanstvenici su dosad znali za lokaciju i približan oblik fuzijskog peptida, no nisu znali kako on točno reagira sa staničnom membranom i kako se probija u stanicu te nastaju li promjene u njegovom obliku kad se zalijepi na membranu stanice.

Bez znana svih trodimenzionalnih interakcija između fuzijskog peptida novog koronavirusa i stanične membrane, nije moguće dizajnirati lijekove koji specifično ometaju upravo tu interakciju.

Koristeći računalne simulacije, Gorgunin tim je stopio sve poznato o fuzijskom peptidu s već ustanovljenim trodimenzionalnim strukturama i ponašanjem drugih fuzijskih peptida koronavirusa te simulirao interakciju s modelom membrane ljudske stanice. Njihove simulacije otkrile su kako fuzijski peptid SARS-COV-2 djeluje na i penetrira staničnu membranu.

Naša studija pokazuje koji su dijelovi fuzijskog peptida važni te kako se on lijepi i sjeda u membranu, kaže Gorgun.

Obzirom da je model isključivo teoretski, idući korak je ponoviti te računalne eksperimente u laboratoriju s dijelovima novog koronavirusa i staničnim membranama. No, obzirom da su već otkrili dijelove fuzijskog peptida koji su vjerojatno ključni za tu funkciju, ti će se eksperimenti vrlo vjerojatno lakše i učinkovitije provesti.

Nakon ponavljanja rezultata u laboratoriju, Gorgun kaže da će biti moguće testirati lijekove koji ometaju interackiju pomoću koje SARS-COV-2 pristaje na ljudske stanice.

Izvor: EurekAlert

Vezane vijesti